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如果您的苹果手机在删除短信后仍然显示红点提示，这可能是由于以下几个原因造成的。
1、短信应用未完全刷新：有时，即使您删除了短信，应用程序可能需要一些时间才能更新其状态，尝试关闭短信应用并重新打开，看看红点是否消失。
2、未读短信或分组中的未读消息：确保您已经阅读并删除了所有短信，包括可能的分组或文件夹中的未读消息，有时，即使您认为已经删除了所有短信，仍然可能存在未读消息导致红点提示。
3、通知设置问题：检查您的通知设置，确保没有为短信应用启用任何特殊的标记或提醒，在“设置”中，找到“通知”部分，然后选择“短信”应用，查看是否有关于红点标记的特定设置。
4、软件问题或缓存问题：如果上述方法都不起作用，可能是软件问题或缓存问题导致的，尝试重新启动您的手机，这有助于清除任何临时的软件问题或缓存问题。
5、系统更新：确保您的手机运行的是最新的iOS版本，有时，系统更新可以解决一些与通知相关的问题。
如果尝试了上述方法仍然无法解决问题，建议您联系苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求进一步的帮助，他们可能能够提供更具体的解决方案或建议。